О.А. Скугаревским ведется большая работа по совершенствованию преподавания нейронаук в БГМУ, внедрению новых технических средств в учебный процесс и практику обучения врачей. Целям качественного образования будущих врачей служат и введенные по его инициативе элективные курсы «Основы психотерапии», «Основы психосоматической медицины», «Наркология».